Mumificirani ostaci žene su pronađeni u napuštenom bunkeru. NCIS tim otkriva da je žena nestala prije nekoliko mjeseci, te da je nosila vjenčanicu kad je umrla i da je vjerojatno žrtva serijskog ubojice. U potrazi za ubojicom odlaze na Floridu, gdje traže drugu ženu koja je misteriozno nestala nakon odlaska na posao. Jedan od tragova  je stari priručnik za dobre supruge.

Helikopter je otkriven u sredini polja žita u ruralnoj sredini a piloti su nestali. Ubrzo, NCIS otkriva da je samo jedan pilot krenuo na let, te da postoji nekoliko desetljeća stara svađa u gradu, a pilot je željan osvete.

Tijelo žene u uniformi ratne mornarice su pronašla dva mornara. Ducky poveže ubojstvo sa neriješenim slučajem otprije 10 godina, i počinje čudno ponašati. Serijski ubojica ostavlja poruke na tijelu, obećavši da će se vratiti.

NCIS tim je pronašao mjesto na kojem je mafija dugo vremena ostavljala tijela ubijenih. Jedna od žrtava je FBI agent koji je bio na tajnom zadatku. FBI sumnja na krticu te uhićuju Fornella, a Gibbs krene pronaći pravu krticu da bi ga spasio.

Teroristička grupa zaprijeti veteranki iz Iraka te ju NCIS tim odluči zaštititi. Dok pokušavaju uvjeriti FBI da pomogne, uvjereni su da su uhvatili bombaša. Ali nije sve kako se čini.

Ernie Yost, stariji veteran Marinaca i dobitnik 'Medalje Časti', priznaje ubojstvo svog najboljeg prijatelja prije 60 godina u ratu. Posao NCIS tima je istražiti sve tajne i spasiti Ernia od zatvora.

Mornarički Zapovjednik umire nakon uspješne operacije. Dok istražuju njegovu prošlost saznaju da je imao nekoliko neprijatelja, te pronađu Zastavnika koji im postane glavni sumnjivac. Uskoro Abby zaključuje da imaju krivog čovjeka.

Žena Marinca upuca uljeza koji ju je pokušao silovati. Tim saznaje da je žena vodila dvostruki život dok joj je muž služio u Iraku. Dopisivala se na Internetu sa strancem te nije znala njegove prave namjere. NCIS zaključuje da ga je ona namamila u svoj dom ne znajući da je on serijski silovatelj.

Dok je na tajnom zadatku kao odbjegli zatvorenik koji je lancem svezan za zatvorenika koji zna gdje su skrivene stare Iračke skulpture, Tony misteriozno nestaje. GPS lokator kojeg je Abby stavila više ne radi pa tim mora naći Tonya jer mu je život u opasnosti.

Tijelo Mornaričkog časnika koji je bio nestao prije 2 godine je pronađeno autu koje je izvučeno iz jezera. Našao ga je privatni istražitelj koji sada želi nagradu koju je ponudila obitelj pokojnika. Slučaj preraste u ubojstvo kad NCIS otkrije metak u autu.

NCIS preuzima čudan slučaj kad im telefonski prodavatelj prijavi moguće ubojstvo dočasnika koji je ubijen dok je pričao na telefon. Uz pomoć Virginia Policije, tim saznaje da je to bila šala. Međutim, osoba je uskoro pronađena mrtva.

'Slagalica mesa' započinje kad Ducky identificira komade tijela koja su bila nagurana u bačvu prije nekoliko mjeseci. Ispostavilo se da tijela pripadaju šerifu i Javnom tužitelju koji su radili s Duckyem prije 10 godina na slučaju silovanja. Gibbs vjeruje da bi Ducky mogao biti sljedeća žrtva te naređuje da čuvaju njega i njegovu majku. No, Duckya ipak otmu te ga sada tim mora pronaći prije nego bude kasno.

Žena tvrdi da je vidjela ubojstvo mornara u stanu preko puta. Gibbs dodjeljuje slučaj McGeeu koji vjeruje da on to može riješiti. No kad nedostatak dokaza baci sumnju na istinitost tvrdnje, McGee nagovori tim da mu pomogne.

Marinac padne sa litice a njegova kamera se skotrlja. Glavni sumnjivac je njegova žena i njegov najbolji prijatelj jer su bili skupa na pikniku. Gibbs saznaje da su njih dvoje bili u vezi te ih pokuša nagovoriti da okrive jedno drugoga. U međuvremenu, Abby rekonstruira slučaj koristeći svoje kompjuterske sposobnosti na mrtvačevoj kameri.

NCIS započne istragu kad je dočasnica Manda King nađena mrtva u krevetu od barmena. Sumnjivac je vlasnik rivalskog kluba u kojem pjeva Mandyna sestra.

Kad dočasnik koji radi u Obavještajnoj službi dobije poštom par plavih očiju, NCIS tim počne istraživati slučaj. Mornar počini samoubojstvo što ih dovodi do njegovog profesora koji radi za CIA u Panami.

Dočasnica koja se vratila na posao je nađena mrtva iza pozornice na bikini natjecanju. Tim sumnja da je žrtvu netko uhodio.

Tim istražuje slučaj samoubojstva vjerujući da je jedini razlog živčani slom, ali Ducky misli da je ubijena. Agent Fornell iz FBI-a im pomaže u istrazi. Tragovi ih vode prema saznanju da je bila uvučena u ljubavni trokut.

Marinac je pronađen mrtav u školskom kampusu i NCIS odmah otkrije sumnjivca. Međutim, ponovno su na početku jer je i on ubijen. Abby otkrije trag u E-mailu, skupinu koja se naziva 'Red Cell' što ih dovodi do toga da su marinci igrali ozbiljnu smrtonosnu igru.

Kad mladi Marinac u Iraku pogine dok spašava ljude, tijelo mlade žene je pronađeno u garaži u njegovom gradu, te je proglašen ubojicom. Gibbs vjeruje da je nevin te odluči dokazati to.

Kad Tony otvori misterioznu omotnicu misleći da je za njega, iz nje se rasprši bijeli prah. Kate i Tony su stavljeni u karantenu zbog sigurnosnih razloga dok Gibbs i McGee pokušavaju saznati tko je poslao omotnicu i kako izliječiti svoje prijatelje. U međuvremenu, Tonyevo zdravlje se pogoršava.